1991年1月成立晴隆縣排污監(jiān)理站，為晴隆縣建設(shè)局內(nèi)設(shè)股站，屬于事業(yè)編制；1997年定為行政編制。

2001年12月27日晴隆縣人民政府辦公室關(guān)于印發(fā)《晴隆縣環(huán)境保護局職能配置內(nèi)設(shè)機構(gòu)及人員編制方案》的通知（晴府辦發(fā)[2001]111號）成立晴隆縣環(huán)境保護局。編制10人，參照實行國家公務(wù)員制度，財政全額預(yù)算。領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)：局長1名，副局長2名，主任科員或副主任科員2名，股級領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)3名。內(nèi)設(shè)機構(gòu)：辦公室、開發(fā)建設(shè)項目管理股、環(huán)境監(jiān)理站。

2002年5月17日中共晴隆縣委機構(gòu)編制委員會辦公室關(guān)于明確縣環(huán)境保護局內(nèi)設(shè)環(huán)境監(jiān)理站機構(gòu)性質(zhì)的通知（晴機編辦[2002]9號），將晴隆縣環(huán)境保護局內(nèi)設(shè)環(huán)境監(jiān)理站定為事業(yè)機構(gòu)，其人員編制從已定事業(yè)編制中調(diào)劑4名使用；2002年6月14日，中共晴隆縣委機構(gòu)編制委員會辦公室關(guān)于縣環(huán)保局三定方案的補充通知（晴機編辦[2002]11號）增設(shè)“環(huán)境監(jiān)測站”機構(gòu)，為縣環(huán)境保護局下設(shè)股級事業(yè)單位，享受專業(yè)技術(shù)職稱待遇，領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)1名，事業(yè)編制3名。

2003年將“晴隆縣環(huán)境監(jiān)理站”更名為“晴隆縣環(huán)境監(jiān)察大隊，隸屬于晴隆縣環(huán)境保護局，人員編制5名，參照國家公務(wù)員管理的事業(yè)單位，財政全額撥款。

2006年12月30日，《中共晴隆縣委機構(gòu)編制委員會辦公室關(guān)于縣環(huán)保局設(shè)事業(yè)機構(gòu)的通知》（晴機編辦[2006]12號），增設(shè)局下屬事業(yè)“污控站”，該機構(gòu)為股級事業(yè)單位，負責全縣廢水、廢氣、固體廢棄物、噪聲、放射性物質(zhì)等管理和排污費、排污水費的征收管理工作。設(shè)站長1名，副站長1名，定事業(yè)編制8名，財政全額撥款。

2007年11月23日，《中共晴隆縣委機構(gòu)編制委員會辦公室關(guān)于增加縣環(huán)保局環(huán)境監(jiān)察大隊事業(yè)編制的通知》（晴機編辦[2006]12號），縣環(huán)保局環(huán)境監(jiān)察大隊增加10名事業(yè)編制。

2008年11月19日，《晴隆縣人民政府辦公室關(guān)于印發(fā)縣環(huán)保局主要職責機構(gòu)設(shè)置人員編制規(guī)定的通知》（晴府辦發(fā)[2008]211號），晴隆縣環(huán)境保護局屬縣人民政府組成部門，正科級規(guī)格，參照公務(wù)員法管理。內(nèi)設(shè)機構(gòu)為：辦公室、開發(fā)建設(shè)項目環(huán)境管理股（含生態(tài)保護職能）、環(huán)境監(jiān)察大隊。所屬事業(yè)機構(gòu)：污控站、監(jiān)測站。其中：辦公室設(shè)主任或副主任1名，定事業(yè)編制1名；開發(fā)建設(shè)項目環(huán)境管理股設(shè)股長1名，定事業(yè)編制1名；環(huán)境監(jiān)察大隊設(shè)監(jiān)察大隊長或副大隊長1名，定事業(yè)編制10名；污控站設(shè)站長1名，副站長1名，定事業(yè)編制8名。其中職員（管理人員）類3名，專業(yè)技術(shù)人員類5名；監(jiān)測站設(shè)站長或副站長1名，定事業(yè)編制3名，其中職員（管理人員）類1名，專業(yè)技術(shù)人員類2名。

2011年3月16日，《晴隆縣人民政府辦公室關(guān)于印發(fā)晴隆縣環(huán)境保護主要職責內(nèi)設(shè)機構(gòu)和人員編制規(guī)定的通知》（晴府辦發(fā)[2011]154號），晴隆縣環(huán)境保護局為縣人民政府工作部門。